Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms