Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A3Q01959 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms