Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms