Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms