Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIP4K2BP78356 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms