Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBA52P62987 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
UBA52P62987 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBA52P62987 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA52P62987 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms