Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RND3P61587 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RND3P61587 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RND3P61587 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RND3P61587 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RND3P61587 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RND3P61587 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RND3P61587 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RND3P61587 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RND3P61587 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RND3P61587 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RND3P61587 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RND3P61587 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RND3P61587 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RND3P61587 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RND3P61587 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RND3P61587 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RND3P61587 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RND3P61587 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RND3P61587 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RND3P61587 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RND3P61587 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RND3P61587 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RND3P61587 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RND3P61587 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RND3P61587 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms