Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms