Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms