Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP12P59046 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms