Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3AP57075 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms