Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN15P56746 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms