Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BGRP55822 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms