Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms