Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THOP1P52888 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THOP1P52888 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THOP1P52888 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
THOP1P52888 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THOP1P52888 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THOP1P52888 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THOP1P52888 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
THOP1P52888 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
THOP1P52888 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THOP1P52888 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
THOP1P52888 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
THOP1P52888 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THOP1P52888 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
THOP1P52888 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
THOP1P52888 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
THOP1P52888 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THOP1P52888 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THOP1P52888 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms