Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms