Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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