Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK8P49336 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CDK8P49336 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK8P49336 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK8P49336 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK8P49336 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK8P49336 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK8P49336 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK8P49336 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK8P49336 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK8P49336 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK8P49336 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms