Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD2P49005 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD2P49005 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD2P49005 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms