Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms