Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LIPAP38571 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LIPAP38571 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LIPAP38571 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LIPAP38571 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LIPAP38571 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LIPAP38571 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LIPAP38571 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LIPAP38571 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIPAP38571 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms