Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPARGP37231 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGP37231 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGP37231 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms