Protein–RNA interactions for Protein: P35789

ZNF93, Zinc finger protein 93, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF93P35789 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF93P35789 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF93P35789 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms