Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPB2P35606 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPB2P35606 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPB2P35606 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPB2P35606 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPB2P35606 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPB2P35606 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPB2P35606 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPB2P35606 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPB2P35606 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPB2P35606 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPB2P35606 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPB2P35606 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPB2P35606 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPB2P35606 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPB2P35606 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPB2P35606 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPB2P35606 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPB2P35606 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPB2P35606 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPB2P35606 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms