Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms