Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms