Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms