Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms