Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms