Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms