Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRF1P14222 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRF1P14222 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRF1P14222 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRF1P14222 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRF1P14222 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRF1P14222 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRF1P14222 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms