Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC130P13994 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms