Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH1P12830 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH1P12830 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH1P12830 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH1P12830 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH1P12830 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH1P12830 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH1P12830 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH1P12830 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH1P12830 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH1P12830 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH1P12830 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH1P12830 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms