Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms