Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL3P10147 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL3P10147 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL3P10147 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL3P10147 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL3P10147 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL3P10147 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3P10147 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms