Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX7O95931 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX7O95931 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX7O95931 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX7O95931 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX7O95931 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX7O95931 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX7O95931 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX7O95931 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX7O95931 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CBX7O95931 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CBX7O95931 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms