Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX58O95786 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX58O95786 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX58O95786 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DDX58O95786 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DDX58O95786 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms