Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN7O95471 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms