Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLIT2O94813 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLIT2O94813 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms