Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNKO75909 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNKO75909 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNKO75909 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNKO75909 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNKO75909 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNKO75909 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNKO75909 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNKO75909 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNKO75909 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNKO75909 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNKO75909 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms