Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPLO60437 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPLO60437 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PPLO60437 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPLO60437 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPLO60437 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPLO60437 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPLO60437 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPLO60437 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPLO60437 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPLO60437 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPLO60437 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPLO60437 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPLO60437 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPLO60437 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPLO60437 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPLO60437 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPLO60437 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPLO60437 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPLO60437 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPLO60437 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PPLO60437 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PPLO60437 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPLO60437 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPLO60437 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPLO60437 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms