Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ2O43526 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms