Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTIFO43310 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTIFO43310 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTIFO43310 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTIFO43310 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTIFO43310 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTIFO43310 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTIFO43310 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTIFO43310 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTIFO43310 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTIFO43310 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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