Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMD3O43242 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms