Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBDO15205 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBDO15205 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBDO15205 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms