Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNJ2O15056 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNJ2O15056 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNJ2O15056 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNJ2O15056 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNJ2O15056 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNJ2O15056 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNJ2O15056 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms