Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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