Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DFFAO00273 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DFFAO00273 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DFFAO00273 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DFFAO00273 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DFFAO00273 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DFFAO00273 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms