Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKBIEO00221 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms