Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRN3E7EW58 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms